Las manchas de óxidos provienen normalmente de la oxidación de las varillas de hierro, llamadas ferrallas», que se embuten principalmente en las piscinas de hormigón acabadas en gresite.
Si fuese por este motivo piensa que el agua de la piscina ha llegado a tocar las ferrallas de parte de los muros de tu piscina y lógicamente cada vez tendrás más manchas de óxido que se agravarán si utilizas cloración salina.
Te recomiendo que te pongas en contacto con tu instalador para que, juntos, podáis consensuar una una mejor solución.